Em situações extremas, quando o biofilme esta constituído por incrustações extremamente duras, como alguns casos de calcário, utiliza-se a limpeza a alta pressão. A limpeza consiste na utilização de equipamentos de alta pressão com acessórios específicos para limpeza no interior de condutas de água para consumo humano.
CLEANING-PIGS
Consiste na introdução de vários cleaning-pigs no interior da conduta a limpar, os quais são arrastados pela própria água, removendo o biofilme que se encontra depositado nas paredes internas da conduta. A escolha dos cleaning-pigs a utilizar tem em conta entre outras características, o tipo de biofilme a remover, o material da conduta, secção e acessórios existentes.